藥師佛為東方淨琉璃世界之教主。於過去世行菩薩道時，曾發十二大願，願為眾生解除疾苦，使具足諸根，導入解脫，故依此願而成佛，住淨琉璃世界，其國土莊嚴如極樂國。
藥師法會目的在於發揚藥師如來濟苦的精神，十方信眾藉著虔誠誦經、稱念名號、禮拜聖像和點燈、佈施、供養來禮讚光明廣大的藥師佛，希望能藉由藥師如來的慈悲願力，令眾生解脫的災難和痛苦，更能迴向到天下所有需要濟助的眾生，離苦得樂、世界和平吉祥。
健康是每個人生活中重要的一環，有時突如其來的一個「病」打亂了一個人原本的生活。在還有機會時能多參與藥師法會，台南分院每月農曆十五舉辦藥師法會，化解本身身體病痛，有時看醫生沒有效果。身上有陰氣藉著法會功德力請無形因果業障歸位、累世因果化解，能夠藥到病除。
《藥師琉璃光如來本願功德經》記載，藥師佛因不忍有情苦，發下十二大願，小至去除有情饑寒、根缺、天災、人難等種種身心怖畏，大至究竟解脫眾生一切憂苦，持誦經文，心中自然湧現光明穩定的力量。祈願一切有情同霑法益，共證菩提。
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